Historia badań i studiów w zakresie turkologii sięga 1919 roku, kiedy to prof. Tadeusz Kowalski otworzył na Uniwersytecie Jagiellońskim pierwsze w niepodległej Polsce studia orientalistyczne.
Uznawany za prekursora polskiej turkologii prof. Kowalski zainicjował badania nad turecką dialektologią, literaturą, językiem. Był też autorem prac poświęconych badaniom nad językami podgrupy kipczackiej, a także nad tureckimi zapożyczeniami w języku polskim.
Obecnie badania prowadzone przez pracowników Katedry Turkologii reprezentują następujące obszary badawcze:
- językoznawstwo tureckie (diachroniczne i synchroniczne),
- historia języka osmańsko-tureckiego,
- współczesna literatura turecka,
- literatura osmańsko-turecka,
- przekładoznawstwo,
- historia Turcji,
- kultura Turków,
- Turcja współczesna,
- dialektologia,
- historia turkologii.
Katedra Turkologii współpracuje z wieloma ośrodkami akademickimi w kraju i za granicą.
W ramach programu Erasmus prowadzi współpracę z uniwersytetami w Turcji (Ankara, Antalya, Bartın, Eskişehir, Stambuł, Tokat), Litwie (Wilno) i Włoszech (Pescara/Chieti).
Wiedza ekspercka jej pracowników wykorzystywana jest także m.in. przez Ministerstwo Sprawiedliwości RP, Ministerstwo Spraw Zagranicznych RP oraz różne ośrodki badawcze i opiniotwórcze.